Berikut adalah makna dari logo SDN 1 Bugeman

• 6 perisai biru di atas bermakna 6 profil pelajar Pancasila yang menjadi visi sekolah
• 4 perisai hijau di bawah bermakna 4 komponen di ekosistem SDN 1 Bugeman yaitu guru, murid, orang tua, dan masyarakat
• 3 lembar buku dengan dasar berwarna biru, hijau, dan kuning melambangkan kompetensi yang menjadi dasar pengembangan diri murid SDN 1 Bugeman meliputi sikap religius, sikap sosial, dan pengetahuan keterampilan
• 2 bintang di sebelah kanan dan kiri melambangkan semangat SDN 1 Bugeman yang menuntun murid sehingga berkembang sesuai dengan kodrat alam dan kodrat zaman
• Siluet peta Situbondo dengan garis pantai dan laut berwarna biru menjadi komitmen SDN 1 Bugeman untuk mengembangkan sistem pembelajaran yang menjawab tantangan dan kebutuhan sosial budaya masyarakat Situbondo